冷冻电子显微镜显示了VH Ab6抗体片段(红色)如何附着在SARS-CoV-2尖峰蛋白(灰色)的脆弱部位,以阻止病毒与人类ACE2细胞受体(蓝色)结合。
这项研究发表在《自然-通讯》杂志上,它使用低温电子显微镜(cryo-EM)来确定病毒尖峰蛋白上的脆弱区域或表位的原子结构。该研究还报告了一个VH Ab6抗体片段,它能与该位置结合并中和每一个主要变体。
UBC大学医学院教授、该研究的资深作者Sriram Subramaniam博士说:"这是一种高度适应性的病毒,已经进化到可以逃避大多数现有的抗体治疗,以及疫苗和自然感染赋予的大部分免疫力。这项研究揭示了一个弱点,这个弱点在不同的变体中基本没有变化,可以被一个抗体片段中和。它为设计有可能帮助许多脆弱人群的泛变种治疗方法创造了条件。"
(资料图)
识别COVID-19的万能钥匙
我们的身体自然地制造抗体来对抗感染,但它们也可能在实验室中被制造出来,并作为一种治疗方法给病人使用。尽管已经为COVID-19创造了一些抗体治疗方法,但面对像Omicron这样高度变异的变体,它们的疗效已经下降。
"抗体以一种非常具体的方式附着在病毒上,就像一把钥匙进入一把锁。但当病毒发生变异时,钥匙就不再适用了,"Subramaniam博士说。"我们一直在寻找万能钥匙--即使在广泛的变异后仍能继续中和病毒的抗体。
这篇新论文将抗体片段VH Ab6确定为"万能钥匙",已经发现它对Alpha、Beta、Gamma、Delta、Kappa、Epsilon和Omicron变种有效。通过与尖峰蛋白上的表位结合并阻止SARS-CoV-2感染人体细胞,该片段可中和病毒。
这一发现是苏布拉马尼亚姆博士的团队与匹兹堡大学Mitko Dimitrov和Wei Li博士领导的同事之间长期而富有成效的合作的最新成果。匹兹堡的团队一直在筛选大型抗体库并测试它们对COVID-19的有效性,而UBC的团队一直在使用低温电镜研究尖峰蛋白的分子结构和特征。
专注于COVID-19的薄弱点
UBC团队因其在使用低温电镜以原子分辨率观察蛋白质-蛋白质和蛋白质-抗体相互作用的专业知识而闻名于世。在今年早些时候发表在《科学》上的另一篇论文中,他们首次报告了Omicron尖峰蛋白和人类细胞受体ACE2之间的接触区结构,为Omicron增强的病毒适应性提供了分子解释。
通过绘制每个尖峰蛋白的分子结构图,该团队一直在寻找可能为新疗法提供信息的脆弱区域。
苏布拉马尼亚姆博士说:"我们在这篇论文中描述的表位大多远离突变的热点,这就是为什么它的能力在不同的变体中得以保留。现在我们已经详细描述了这个部位的结构,它开启了一个全新的治疗可能性领域。"
Subramaniam博士说,这个关键的弱点现在可以被制药商利用,而且由于该部位相对无突变,所产生的治疗方法可以对现有的,甚至是未来的变种有效。
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